さくらインターネットのサーバーにMovable Typeをインストールして、再構築したら500エラーが出て表示できない状態。

これは、拡張子を.phpにしている場合に発生するパーミッションエラーです。

さくらのサーバーでMovable Typeを再構築して生成される.phpファイルは、パーミッションが「666」になるので表示できないというだけ。（FTPでパーミッションを「755」に変更すると表示できる）

mt-config.cgiをエディターで開いて、以下のコードを入力して上書き保存すると、再構築で生成される.phpファイルのパーミッションを「755」にすることができます。

HTMLUmask 0022
DirUmask 0022

HTMLPerms 0777

（MT 5.2.13で確認）

Source: CSS Lecture